دانشمند روسی: “ما درباره COVID-19 همه چیز را می دانیم ، اما هیچ چیزی در مورد آن نمی دانیم”

دانشمندان روسی برای جستجوی مواد دارویی جهت استفاده در درمان Covid-19 روش مبتنی بر رایانه را پیشنهاد كردند. این در یک نشست آنلاین که توسط وزارت علوم و آموزش عالی فدراسیون روسیه ، آکادمی علوم روسیه و پورتال علمی روسیه برگزار شد ، مورد بحث قرار گرفت.

تضادهای Coronavirus

وضعیت coronavirus به طرز چشمگیری بر همه جوانب زندگی انسان تأثیر می گذارد.

بیش از 19000 اثر درمورد SARS-CoV-2 / COVID-19 طی پنج ماه گذشته منتشر شده است.

“متأسفانه ، بسیاری از این انتشارات با یکدیگر متناقض هستند. ولادیمیر پورایکوف ، عضو مربوط آکادمی علوم روسیه ، رئیس بخش بیوانفورماتیک مؤسسه شیمی بیوشیمیایی اورهکوویچ ، گفت: بعضی اوقات درک این که نتیجه گیری یا نتیجه گیری چقدر خوب است ، دشوار است.

در عین حال ، او معتقد است که جهان شاهد سرعت بی سابقه ای از اکتشافات علمی در زمینه مبارزه با کورو ویروس است. در 25 ژانویه ، اولین ژنوم رمز گشایی شد. امروز ، چندین هزار ژنوم رمزگشایی شده وجود دارد ، و کار همچنان ادامه دارد.

در 5 فوریه ، اولین ساختار آنزیمی سه بعدی به دست آمد ، که باعث می شود بیشتر روش های مدل سازی مولکولی را برای جستجوی داروهای مربوط به ضد COVID-19 استفاده کنید. درک ساختار ویروس و چرخه عمر ویروس به ما امکان می دهد امیدوارترین اهداف را شناسایی کنیم.

این دانشمند خاطرنشان كرد: “علیرغم اینكه همه چیز را در مورد COVID-19 می دانیم ، در مورد آن چیزی نمی دانیم” ، افزود: بسیاری از جنبه های تعامل ویروس با بدن انسان هنوز رمز و راز است.

به عنوان مثال ، این دانشمند با انتشار گزارشی به تازگی در نشریه The Lancet (یکی از معروف ترین ژورنال های پزشکی) اشاره کرده است و می گوید استفاده از هیدروکسی کلروکین و کلروکین (داروهای ضد مالاریا که برای درمان COVID-19 استفاده می شود) قابل استفاده نیست.

در این مقاله از مطالب گسترده بالینی استفاده شده است. با این حال ، چند روز بعد ، سه نویسنده مقاله نام خود را از آن بیرون کشیدند. وی گفت: “این مثال نشان می دهد که روند در حال انجام است و بسیار بحث برانگیز است. ما می توانیم بسیاری از مسائل را تنها post Factum ارزیابی کنیم. اما ما نمی توانیم با ویروس post factum مبارزه کنیم ، اکنون باید با آن مبارزه کنیم. “

درمان “جدید” قدیمی فراموش شده است

با توجه به اینکه به جستجوی و ایجاد واکسن زمان زیادی می برد ، دانشمندان در تلاشند تا داروهای موجود را دوباره ترمیم کنند. اولین تلاش برای استفاده مجدد از دارو (دیپیریدامول ، یک عامل ضد پلاکت مشهور) در ماه مارس انجام شد که یک برنامه رایانه ای نشان داد که همراه با اثر ضد پلاکت آن ، این دارو پروتئیناز اصلی ویروس را مهار می کند.

این امر در شرایط آزمایشگاهی تأیید شد و دانشمندان چینی بلافاصله به مرحله آزمایش انتقال یافتند. دو تیم تحقیقاتی بزرگ یک جستجوی سیستماتیک مواد مخدر انجام دادند یکی از آنها 13 ترکیب فعال یافت ، در حالی که دیگری 64 مورد پیدا کرد.

کار در سیستم های مختلف تست انجام شد. هیچکدام از داروها با هم تلاقی نمی کنند. این دو اثر دو نتیجه متفاوت است. بدیهی است که چنین نتایج نیاز به روشن سازی دارد ، “دانشمند گفت.

انستیتوی شیمی بیوشیمی Orekhovich تلاش خود را برای استفاده مجدد از مواد مخدر انجام داد. يكي از داروها (نراتينيب) به عنوان مهار كننده پروتئازاز اصلي ويروس شناسايي شد. اکنون این باید به صورت تجربی ثابت شود.

پیش بینی رایانه

با شروع همه گیر ، پروژه Grand Challenge Against Covid-19 در اروپا راه اندازی شد. برگزارکنندگان پروژه شش هدف را پیشنهاد کردند. مواد لازم برای این اهداف با استفاده از سه روش رایانه ای مستقل با بیش از 1 میلیارد ساختار در دسترس از جمله داروهای تصویب شده برای مصارف پزشکی یافت می شود.

به سرپرستی ولادیمیر پورایکوف ، دانشمندان روسی که بیش از 30 سال در حال توسعه برنامه های رایانه ای PASS هستند و بیش از 5000 نوع فعالیت بیولوژیکی را پیش بینی می کنند ، 4 هدف را انتخاب کرده اند: پروتئاز اصلی ، پروتئین پاپین ، پروتئاز وابسته به RNA و پروتئاز غشای انسانی. ، که به ویروس کمک می کند تا درون سلول نفوذ کند.

ما در زمینه کار با Big Data تجربه داریم: حدود یک میلیارد ترکیب شیمیایی مرتبط با یک پروژه در انستیتوی ملی سرطان ایالات متحده. برای تحقیق از سه روش استفاده کردیم: جستجوی تشابه ، یادگیری ماشین و داکینگ. پروژه قبلی نشان داد که ترکیبات فعال با چنین روشهایی می توانند یافت شوند. ” در مرحله آماده سازی نمونه های آموزشی ، دانشمندان نیاز به انجام تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک بین انواع مختلف ویروس و شامل مواد دیگر انواع ویروس ها در این نمونه های آموزشی داشتند.

در طی تحقیق دانشمندان روسی نتیجه گرفتند که مسئله داروسازی باید به طور جامع تجزیه و تحلیل شود – از آموزش آماده سازی نمونه ها و آموزش یک سیستم محاسبه اطلاعات ویژه گرفته تا انتخاب مولکول های امیدوارکننده بر اساس پیش بینی و آزمایش.

به گفته کارشناسان ، برای به دست آوردن نتایج قابل اعتماد هنگام جستجوی داروهای جدید ، همه چیز باید تا حد امکان هماهنگ باشد.

در حال حاضر ، بیش از 32 هزار مولکول که به طور بالقوه می توانند روی هدف تأثیر بگذارند ، انتخاب شده اند ، آنالیز دستگاهی انجام شده و چندین مهارکننده بالقوه انتخاب شده اند که برای آنها مدل سازی مولکولی تعامل خوبی با پروتئاز اصلی ویروس نشان داده است.

وی گفت: “در مورد COVID-19 ، ما مجبور شدیم نمونه های آموزش را از ابتدا ایجاد کنیم. برنامه پیش بینی داروهای ضد coronavirus تقریبا آماده است. ما نتایج اول را در ماه آینده ارائه خواهیم داد. “